1.耐储藏
光合细菌(PSB)能增强果品的耐贮性。在温洲蜜柑收果前的7、8、9月先后共施用3次PSB，对照组只施用化肥，12月收果后发现对照组的蜜柑自然存放至次年2月，几乎全部腐烂，而施用3次PSB菌肥的果，自然存放至次年4月仍未见腐烂，耐贮性显著提高。
2.降解农残
PSB在蔬菜种植以及农残降解等方面也取得了良好的效果。PSB对农作物生长以及果实品质有显著的促进和改善。通过筛选得到的具有降解农药能力的光合细菌菌株，在光合细菌体内酯酶催化下，对酯类和有机磷农药有较好的降解能力。由于农业中大量使用化肥与农药，导致土壤中残留多种有害物质（包括H2S和硝酸盐），影响农作物的根系和植株的发育生长，同时光合细菌以硝酸盐为电子受体，通过亚硝酸还原酶和硝酸还原酶的作用（把硝酸盐还原成氨基酸或氮气），降低蔬菜中的硝酸盐含量，从而减少对人体的危害。光合细菌能有效地分解这些物质，具有净化土壤的作用。
3.提高植物抗逆性
植物体内的超氧化物歧化酶（SOD）和过氧化物酶（POD）在植物应答胁迫过程中具有非常重要的作用。实验检测了光合细菌菌剂处理后苗期水稻体内的SOD和POD含量，发现光合细菌灭菌液浸种处理、水浸种处理和光合细菌培养基浸种处理后，水稻苗期受干旱胁迫的SOD和POD含量大体相同，但光合细菌浸种处理后，水稻苗期受干旱胁迫的SOD值和POD值都明显增加，SOD值提高72%，POD值提高38.5%。
4.促进发芽和增长
在小麦应用研究领域中，胡青平等在实验室水平研究了PSB浸种对小麦萌发的影响，发现稀释液提高了小麦萌发过程中可溶性蛋白和还原性糖含量，并对细胞膜具有一定的保护和修复作用，从而促进其萌发。光合细菌还富含脯氨酸和尿嘧啶等，这些物质作用于作物的生殖生长期，能促进花芽形成，提高结实率，同时提高果实品质。提高土壤肥力，改善土壤盐化、板结现象。茶树上施用光合细菌可以促进茶树多产叶，并增加其单株发芽数，而且叶色教嫩绿，提高茶叶质量。
5.提高土壤微生物的活性
光合细菌不仅促进土壤中的固氮菌、放线菌的生长，而且还促进土壤中的嫌气性纤维素分解菌、硝化细菌、硫化细菌、氨化细菌的生长，同时对土壤中的好气性纤维素分解菌有较强的抑制作用，对反硝化细菌也有所抑制。由于土壤中有机质和微生物总量增加，加速了土壤团粒结构的形成及土壤养分再生与有效化，为植物生长创造了一个良好的生长环境，是为PSB能使植物增产的主要原因之一。由反硝化细菌引起的反硝化作用，是造成农田土壤中氮肥损失的主要原因，说明光合细菌能减少土壤中氮素的损失。
6.增强光合作用
光合细菌产生的许多促生因子、维生素、辅酶Q和光合色素等，可诱导植物的抗病毒活性，提高作物光合作用的能力。通过对水稻施用光合细菌能提高其体内的叶绿素含量，增强作物的光合机能和提高逆境下的光合效率，增加物质积累，在水稻营养生长阶段使叶片颜色加深，叶片数增加，分蘖数增加，全面提高作物的产量以及改善产品质量。叶绿素是光合作用中能量转化的物质基础，是PSB影响小麦生长的重要参考指标。活性代谢物质，如维生素、辅酶Q和光合色素等，加速了小麦的营养生长。沼泽红假单胞菌液对于小麦的生长促进作用最为明显。施用光合菌肥可以改善大铃铛枣叶片的光合特性，提高枣叶片气孔导度与净光合速率，可改善大铃铛枣的口味、提高其产量和品质。
7.增加土壤肥力
喷施PSB的作物，对土壤各种养分的吸收明显增加。在肥力相近的土壤中种植大豆和甘薯，收获时土壤中有机质、全氮、速效N、速效P、速效K和阳离子交换能力值均较大幅度减少,而植株内相应的养分含量则增加。从而烟草、萝卜、甘薯和大豆分别增产13.6%、58.9%、78.6%和52.2%。